Dalam perjalanannya, Sekolah Madania senantiasa mengalami pembaharuan – pembaharuan untuk mewujudkan cita – cita para pendirinya seperti yang terangkum dalam visi – misi Sekolah Madania yakni mempersiapkan peserta didik untuk menjadi generasi para pemimpin yang memiliki kesadaran akan Tuhan, berwawasan internasional, berkarakter mulia, dan menjunjung tinggi nilai-nilai luhur dan tradisi Indonesia.

Berdasarkan visi tersebut, Sekolah Madania secara kontinu menyiapkan generasi yang mencintai bangsanya, memahami kondisi negerinya, menghargai pahlawannya, dan menjaga segala kekayaan yang ada di dalamnya, sehingga jiwa nasionalisme itu tak henti ditumbuhkembangkan. Melalui ilmu pengetahuan dan budaya, sebagai insan pendidikan, cita-cita itu melebur dan tercermin menjadi karakter, identitas, dan jiwa yang baru. Jiwa Madania, jiwa Indonesia.